当染色体出现数目畸变或结构畸变、基因突变或先天性代谢缺陷时就可产生先天性畸形，表现出个体的发育异常。
近年来的研究认为，遗传因素在脑性瘫痪中影响越来越大。某些患儿可追溯出家族遗传病史，在同辈或上辈的母系及父系家族中有脑瘫、智力障碍或先天畸形等。
母体在胚儿期遭受风疹、巨细胞病毒、弓形体病、梅毒、单纯疱疹病毒、EB病毒等感染通过胎盘侵及胎儿产生先天性感染与畸形。
胚胎在母体子宫内发育时，极易受外界环境因素如物理、化学或生物因子的影响，尤其对8周以内的胚胎更为敏感，引起胚胎的分化发育障碍，产生先天性畸形。
高产次，高孕次，有死胎死产史，早产、流产史，双胎或多胎，胎儿发育迟缓，宫内感染，宫内窘迫，胎盘早剥，胎盘功能不良，妊娠反应重、脐带绕颈、急产，不恰当助产，产钳分娩，臀位产，产程长，早产儿或过期产儿低出生体重儿。
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