先天性遗传性

1.毛根鞘囊肿：过去114度脂腺囊肿属常染色体显性遗传。

2.多发性脂囊瘤：为常染色体显性遗传。

3.皮样囊肿：为先天性生后即有。

4.支气管源性与甲状腺舌骨导管囊肿为先天发育不良异常所致。

5.阴茎中线囊肿为先天发育异常所致。

6.发疹性炭毛囊肿病因不清有的报告认为属常染色体显性遗传。

内分泌因素

内分泌因素也是导致囊肿发生的一个很重要的因素，未产妇或未育妇的发病率增加，而妊娠对卵巢癌似有保护作用;月经初潮偏早(12岁之前)、绝经时间在50岁之后、月经过频、应用促排卵剂超过3个周期(使用时应与您的医师讨论)、性早熟或男性化等也与卵巢囊肿的发生有关。

体内毒素导致

由于每个人的体质和机体各方面功能有所差异，而导致有的人体内毒素较多从而引起囊肿发生。

饮食因素

囊肿的发生和人们的饮食有着密切的关系，食物的污染，如蔬菜等使用的植物生长激素，如家畜家禽等配方饲养中瘦肉精类的激素成份。研究还发现，欧美国家肿瘤的高发病率可能与食物中胆固醇含量高有关系。

周遭环境导致

如整天身处于一个充满抽烟的环境中，或处于一个辐射较多的区域从而导致体内发生囊肿的概率加大。

不良生活习惯

如果没有一个好的生活习惯，心理压力过大等因素造成体质过度酸化，人体整体的机能下降，引起肾虚，肝肾同源，肾卵巢囊肿病理虚肝亦虚，进而引起下焦代谢循环变慢，造成卵巢疾病和内分泌失调，免疫功能下降，从而发展为卵巢组织异常增生，终致卵巢囊肿，甚至癌变。

其他疾病诱发囊肿

在生活中存在有各种疾病，没有得到较好医治或者在医治后恢复不乐观从而出现感染引发囊肿的发生。