胚胎染色体异常

胚胎染色体异常，占早期自然流产50%以上的病因。有些夫妇是染色体异常携带者如平衡异位、罗氏异位等，虽然从外观上看无异常，但他们孕育的胚胎很大几率会出现染色体异常，最终发育障碍，以流产告终。

另外，配子及合子在发育过程中对外界环境极其敏感，环境中的致畸因素，包括放射线、病毒、药物等因素均有可能造成染色体异常。对于这部分胚胎来说，流产起到“优胜劣汰”的作用，自然选择，淘汰异常胚胎，其实对于维持物种的稳定性具有重要意义。

精子质量异常

男性长期处于高温、辐射环境，或酗酒、吸烟等，可能改变精子质量，导致受精卵异常而发生流产。

环境因素

如过多接触苯、甲醛、铅、离子辐射等，造成胚胎异常而发育终止。

免疫机能异常

很多原来被认为是“不明原因的流产”，现在发现与免疫因素密切相关，而且可能是导致反复流产的重要原因。怀孕后，受精卵必须在子宫内生长，从免疫角度讲相当于同种移植，形象一点比喻，就是子宫内有某种抗体能够起到“封闭”作用，把胚胎好好地保护起来。

如果缺乏这种抗体，子宫就会以为胚胎是个“坏东西”，于是动用免疫系统对胚胎展开“攻击”，把胚胎当成异物排出体外。