胎儿多囊肾是一种隐性遗传病，主要与基因有关系。
一般多囊肾的胎儿都有家族史，即家族成员中有人有此病，这不一定是父母，也可能是上上代的人。所以，有这种家族史的朋友，不管是孕期还是胎儿出生后，都应特别注意多囊肾、肾囊肿的发生。
除了遗传外，孕前或孕早期长期待在严重污染的环境中生活，有或者接触有毒化学物质(包括服用肾毒性药物)或射线，也可能导致胎儿出现多囊肾。
因人而异。
若胎儿的染色体正常并且胎儿只有一侧肾脏有多囊肾，另外一侧肾脏正常，这种情况可以继续妊娠。
若胎儿多囊肾的同时还合并有染色体异常造成的胎儿畸形，则建议尽早终止妊娠。因为这样的胎儿往往在出生后不久就会发生死亡。即使存活下来，可能也不能成长到成年期。
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