胎儿头颅磁共振是孕期怀疑胎儿头脑异常的一种辅助检查，它可以检查出胎儿是否先天性脑积水、有无神经管畸形(包括无脑儿、脑膨出、脑脊髓膜膨出、脊柱裂等)、囊性腺瘤样畸形等，这些情况一旦确诊，都会建议引产。
磁共振除了能检查胎儿颅脑问题外，还可以对胎儿腹部、胎盘异常等问题进行评估检查。
胎儿头颅磁共振检查是通过磁共振现象，从人体中获得电磁信号并对重建人体信息，从而发现是否有异常的。它跟ct检查不同，本身是没有辐射的，并不会对胎儿产生不良影响，准妈妈可放心进行。
不过，孕早期的准妈妈不宜做磁共振，因为磁共振检查时产生的噪音和热量会影响胚胎发育，容易畸形。
并不是所有胎儿都要做磁共振，只有怀疑胎儿颅脑发育异常，且超声检查不能明确诊断，才需要通过该检查来辅助确诊。
胎儿头颅磁共振可在孕七个月以后做，此时它的清晰度比彩超效果好，可以很好的发现胎儿颅骨发育的异常，以及对先天缺陷的诊断。
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